在事业单位领导跳过科长安排科员干事情，科员直接跳过科长向上汇报工作，科长该怎么办？
很简单，显然领导和科长的关系已经僵化或者不可调解，那既然领导首先出招了，并且意图架空你，那作为科长，咱问心无愧，就只能见招拆招了，而且要化被动为主动！
一、守好基本盘。作为科长，
我做办公室科员的时候，领导让我有事直接向他汇报，原话是：你们主任每天瞎指挥，你们有事直接给我汇报。可能领导也意识到这样影响不好，补充了一句：你们也要主动向主任汇报，倒逼主任开展工作。
我是@职场取经阁 ，关于您的提问，我们必须有严重的危机感，这种状况的出现，说明您已经上不得领导重视、下不得所属拥护，必须果断出手，扭转局面。
一、领导、科长、科员间的关系
体制内单位非常重视层级管理的。领导管理科长，科长管理科员，科长对领导负责，同时也对科员负责。这三者关系之间，科长起着重要的纽带作用。
当领导跳过科长安排科员工作、科员跳过科长向上汇报工作现象出现后，这三者间的领导和被领导关系瞬间打破，轻则影响同事关系，重则扰乱正常办公秩序，必须高度重视。
二、领导、科长、科员关系打破的分析
由于您提问的核心是科长怎么办，属于个人问题。所以，我站在您的立场进行分析，抛开对正常办公秩序的剖析。
（一）领导跳过科长安排科员工作的分析
作为一级领导，必然明白职场的规则，必然明白层级管理的重要性。事出反常必有妖，需要谋定而后动。
领导对科长的工作不满意。体制的提拔晋升，是需要成绩说话的。领导跳过科长安排科员工作，一方面有领导性格的特征，喜欢一竿子捅到底抓落实，这样速度快、执行力强；另一方是领导认为科长领导能力不足，不能够有效完成工作任务。这二者的核心，都暴露出科长能力不强、本领不够。
领导对科长的个人不满意。人与人相处是需要感情的，感情这东西碰不到摸不到。领导跳过科长安排科员工作，间接反映出领导个人对科长的不满意。站在上级的位置上，能回避就回避。
领导与科员间的复杂关系。大家都知道，出了成绩算领导的，出了问题算个人的。作为领导，必然明白这一点。所以，不排除领导想要提拔科员、领导想要针对科员等可能性，跳过科长安排科员工作，要么是架空科长，要么是保护科长，需要您慎重考虑你们间的关系。
（二）科员跳过科长向上汇报工作的分析
能直接和领导接触的科员，必然有一定的工作能力，明白职场的规则。跳过科长向上汇报工作，是典型的越级汇报，是职场的大忌。
科员受到了领导的授意。作为科员，在明知道层级管理的前提下，做出越级汇报的行为，极大可能和我文章开头一样，私底下，被领导安排了，得到了领导的授意。
科员内心不重视科长。体制内，一级管一级的规则，必然有其存在的合理性。科员越级汇报，明显是违反规则的行为。这种行为的出现，直接表现出科员对领导的不重视。正常情况下，即使领导授权，作为科员个人，也必须向科长汇报后，再向领导汇报。
科员被别有用心者挑唆。作为科员，有其思想上的不成熟性。不排除他人背后挑唆，让其对科长个人的人品、工作方式产生质疑，从而做出越级汇报的行为。
科员有自己的小算盘。职场如战场，每个人都谨慎面对。科员公然做出越级汇报的行为，必然有其个人利益的考虑，要么是急功近利，要么是表现自己，要么是制造误会，这些都需要您高度关注。
总之，不论是何种原因，领导跳过科长安排科员工作、科员直接向上汇报工作现象的出现，都对科长的权威和地位产生了严重影响，并且极易出现以点带面的效果，引发其他人效仿，必须严令禁止。
三、解决问题的途径
作为科长，必须给自己定好位，自己首先是组织下令的一级领导，有自己的职责和权利。其次，组织安排自己在这个岗位上，是对自己能力的肯定，毋庸置疑。
第一步，从源头上解决科员越级汇报的行为。按照对事不对人的原则，对科员进行敲打。建议安排不必要的工作给科员做，或者找个借口连续批评科员几次，聪明的人立刻会明白自己被科长盯上了，会反思自己的言行并改正。这里注意：我不建议私底下吃饭和平解决，因为对方能作出这样的行为，和平解决管得了一时，管不了一世。不要担心科员会生气，毕竟是下属，大不了不换思想就换人。
第二步，加强与领导的情感、工作交流。这是这件事的核心，科长这时候要放下架子，不论大事小事主动和领导汇报，让领导看到您对他重视的决心。在条件允许的情况下，加大与领导情感上的交流，这种交流方式，您肯定懂。
第三步，拿出自己的成绩和作风。作为科长，必然有您自己擅长的本领。这时候，突击加班加点，拿出一些成绩给领导看，让领导改变对您的看法。这里需要注意下，私底下您要清楚科员跟领导汇报的内容，认真做点功课，当领导试探询问您时，您要比科员拿出更科学的观点和更翔实的数据。这一点，相信您不难做到，因为您知道的、了解的本身远远比科员多。
划重点，当领导跳过科长安排科员工作、科员直接向上汇报工作现象出现后，不要去就事论事的争执，只会让领导更加误解您。在适当的时候，随口一句的效果，远远大于专门的汇报解释。
我是@职场取经阁 ，希望我的回答对您有所帮助。屁股决定脑袋，科长的格局和视野始终是远远大于科员的，不到万不得@已，领导是不会跳过科长给科员安排工作的，毕竟能力和本领摆在那里。职场上，且行且珍惜。
