原子由质子，中子，电子构成，那么所有原子里的质子都是一样的吗？

题主想要问的是不同原子中的电子、中子、质子之间是否有不同的区别吧？
答案是：目前认为是一样的。
物质结构的不同，是根据基本元素的种类和排列而呈现不同；基本元素是根据原子

不是的！质子和中子是同一种物质的两种不同状态，它们也可以通过跃迁来进行相互间的转化，如同原子核跃迁会放出伽马光子，质子中子之间的跃迁也会放出电子这些物质。而电子则完全不同于中子和质子。

原子由质子、中子和核外电子组成，质子和中子又组成了原子核！

电子，即核外电子（e）,是绕原子核高速运转的粒子,它的排布是分层的(一圈圈的),它的最外层电子个数决定着该原子的化学性质.它的质量是9.11×10-31kg。

原子核由质子和中子组成，质子的质量大约为1.672621637（83）×10-27kg，大约是电子质量的1836.5倍；而中子的质量比质子质量稍微重一点1.674927211（84）×10-27kg。这是因为质子带正电，中子成中性，即质子相比于中子少了电子的质量。一般来说，这个质量可以忽略不计，认为质子和中子质量一样，都等于一个H原子的质量为1。所以一般认为原子的质量就是质子和中子的质量之后，忽略其中电子的质量！