工厂合并导致合同不能继续履行的,应当支付员工赔偿。根据我国《劳动合同法》规定,经济补偿按劳动者在本单位工作的年限,每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上
法律依据
《劳动合同法》第四十七条、第四十四条