如果没有起诉,不可以直接以股权转让协议申请强制执行。因为股权转让协议不具备直接执行的效力,要想执行需要起诉,由法院做出判决后再申请执行庭执行。根据法律规定,发生法律效力
法律依据
《中华人民共和国民事诉讼法》第二百三十六条