经济补偿金不扣除个人所得税。根据个人所得税法相关规定,个人所得税的征税范围是工资、薪金所得;劳务报酬所得;稿酬所得;特许权使用费所得;经营所得;利息、股息、红利所得;财产租赁
法律依据
《中华人民共和国个人所得税法》第二条