运输合同的赔偿金这样算:1、合同有约定的,按照合同约定赔偿;2、没有约定的,双方可以协商制定补充协议;3、不能达成一致的,按照交付或者应当交付时货物到达地的市场价格计算。
法律依据
《民法典》第八百三十三条