女儿今年18，刚上大一，偷偷和男友发生关系了，我该怎么办？

这还真的没有办法。
只能耐心教导。
女孩子真的要自重自爱。不像男孩子，外表上很难查出来(看出来)，女孩子一旦失守，在将来的婚姻生活中会有太多劣势。
我今年48岁，只有一个独生

很多女生上大学第一年就是谈恋爱，出去开房的，好像这也是现在比较常见的事情。

因为高考后，重要解放了，父母不会天天管了，远离了父母，进入大学校园，对爱情的憧憬，对恋爱的美好，开始谈恋爱，一谈恋爱基本上都会做情侣该做的事情，你可以看看没到周末学校门口外面的小旅馆，酒店基本上都是满的，这也是正常现象，成年恋爱人群的正常需求。

但是毕竟你女儿刚满18，刚上大学就把自己交给了男朋友，确实有点早了。毕竟还是学生，还是要保持正常学业毕业，谈恋爱可以，但是不深入了解对方就做出越界行为，确实是为之过早了。很多大学生大学毕业就是分手季，多少情侣最后都得面对现实。如果刚谈恋爱因为一时冲动，就发生关系了，两个人真心相爱没有问题，能走的长远，如果就只是玩玩，最后只会让自己受到伤害了。

作为父母有义务提醒自己的孩子，做好安全手段，避免伤害到自己，作为学生还是要努力学习，以学业为主，努力奋斗。